С конца предыдущего сезона прошел год, и сдерживающий натиск аномалий ЦИА, ключевой персонал которого погиб или затерялся во времени, был реорганизован и стал государственно-частным партнерством. Предприниматель и ученый Филип Бертон (Александр Сиддиг), получивший частичный контроль над Центром исследования аномалий, уверяет, что его интерес исключительно научный, но можно ли ему доверять? Судя по таинственным встречам нового лидера команды (Киаран Макменамин), он не единственный, у кого есть свои скрытые планы. Каковы же их настоящие стремления, и можно ли найти пропавших членов команды?